Фамилия Агамян — типичный пример армянской фамилии, образованной по классической модели с суффиксом -ян. Этот патронимический суффикс (восходящий к древнеармянскому -янц) указывает на принадлежность к роду: Агамян значит «из рода Агама» или «потомок Агама». Ударение в фамилии падает на последний слог: Агамян.

Основа фамилии — личное имя Агам. Это краткая форма от древнеармянского имени Агама, которое, в свою очередь, восходит к библейскому Агагу (в Библии так звали царя амаликитян, упоминаемого в Ветхом Завете). Имя Агам в Армении было распространено как уменьшительно-ласкательное, а со временем закрепилось в качестве самостоятельного.

По географическому распространению фамилия Агамян чаще всего встречается в исторических областях Западной Армении, в частности в регионе Васпуракан (район озера Ван). После геноцида армян 1915 года носители фамилии расселились по всему миру, но значительная диаспора сохранилась на юге России, в Краснодарском крае и Ростовской области, а также в Армении, особенно в Ереване и областях Арарат и Армавир.

В русском языке фамилия не склоняется, если принадлежит мужчине (Иван Агамян), и склоняется, если речь о женщине (Анны Агамян). В армянском оригинале фамилия пишется как Աղամյան, где первая буква «Աղ» передаёт звук, близкий к «ах» или «агх», поэтому в русских документах встречаются варианты Агамян, Ахамян и даже Огамян — это зависит от диалекта и времени фиксации фамилии в метриках.

Социальный состав носителей фамилии был пёстрым: среди Агамянов встречались и крестьяне-земледельцы, и ремесленники, и купцы. В XIX веке несколько представителей рода получили дворянство в Российской империи за заслуги на военной и гражданской службе. Родственных фамилий с той же основой, но разными суффиксами, в армянской ономастике нет — модель -ян здесь единственная, что говорит о древности и устойчивости рода.