Фамилия Агапушкин ведет свое начало от личного имени предка. Фамилия Агапушкин восходит к крестильному мужскому имени Агапий (Агапит), которое в переводе с греческого языка означает «любимый». В основу же фамилии легла его уменьшительная форма — Агапушка. Одним из святых покровителей этого имени считается преподобный Агапит Печерский, который помогал многим больным, которые обращались в Киево-Печерскую лавру. Таким образом, потомок человека, которого звали Агапушка, со временем получил фамилию Агапушкин. Безусловно, фамилия Агапушкин представляет собой замечательный памятник славянской культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Агапушкин можно лишь на основании серьезных генеалогических исследований.