Фамилия Ахатова образована от тюркского имени Ахат, которое переводится на русский язык как «единственный». Часто, так назвали долгожданного первенца. Среди наиболее известных однофамильцев — Ахатов Габдулхай Хурамович, учёный-филолог, доктор филологических наук, профессор, общественный деятель, член Советского Комитета тюркологов, внёсший значительный вклад в исследование диалектов и лексикологических особенностей тюркских языков. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ахатовых можно лишь на основании генеалогических исследований.