Фамилия Ахмеева — женская форма от Ахмеев, а та, в свою очередь, восходит к личному имени Ахмед. Это имя арабского происхождения, одна из форм имени Мухаммад (в переводе — «восхваляемый», «достойный хвалы»). В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имя Ахмед часто адаптировалось как Ахмет, а в некоторых диалектах — как Ахме. Отсюда и фамилия: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть «потомок Ахмеда».

Фамилия Ахмеева распространена в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях. Встречается и у кавказских народов, например у кумыков и чеченцев, где имя Ахмед также популярно. В русской традиции фамилии на -ев характерны для тюркских и арабских заимствований: Тимирязев, Ахмадуллин, но Ахмеев стоит особняком из-за редкого варианта основы.

Редкость фамилии — в её написании. Чаще встречается вариант «Ахметов» (от Ахмет) или «Ахмадеев» (от Ахмади). «Ахмеева» же фиксирует именно форму «Ахмед», которая в русской записи могла утратить конечный «т» под влиянием устной речи. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были мусульманами, и имя Ахмед давали в честь пророка. По сословию — крестьяне или ремесленники, так как в дворянской среде подобные фамилии не закрепились.

В дореволюционных метриках фамилия встречается редко, что говорит о её локальном бытовании. Если искать корни, стоит обратить внимание на татарские и башкирские деревни — там, где имя Ахмед было распространено, фамилия могла возникнуть стихийно, без единого центра.