Фамилия Ахтиманькина — редкий случай, когда в основе лежит не русское, а финно-угорское слово. Корень «ахти» восходит к карельскому или вепсскому междометию «ахти» (ох, ах), выражающему испуг, боль или удивление. В прибалтийско-финских языках это слово могло стать прозвищем для человека суетливого, пугливого или, наоборот, любящего восклицать. Вторая часть — «манькина» — не отдельная основа, а результат сращения с суффиксом -ин и окончанием -а: Ахтиманька → Ахтиманькина.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Ахтиманькин, то есть потомок человека по прозвищу Ахтиманька. Само прозвище Ахтиманька — это усечённая форма от более полного имени или прозвища, например, Ахтиман (где «ман» — от карельского «mies» — мужчина, человек). Таким образом, Ахтиманька буквально означает «человек-ох» или «аховый мужик» — скорее всего, так окрестили эмоционального, крикливого или впечатлительного человека.

Географически фамилия привязана к северо-западу России: Карелия, Архангельская область, Вологодчина. Это регионы, где веками жили карелы, вепсы и русские, и фамилии на -ин с финно-угорской основой — не редкость (ср. Холопов, Лахтин, Сюкияйнен). В переписных книгах Обонежья XVII века встречаются крестьяне с именем Ахти, а в XIX веке в Олонецкой губернии фиксировались фамилии Ахтиев, Ахтимов — все они одного корня.

Написание с двумя «к» — Ахтиманькина, а не Ахтиманина — указывает на то, что в основе был суффикс -к(а), типичный для уменьшительно-пренебрежительных прозвищ. То есть предка звали не просто Ахтиман, а Ахтиманька, что добавляет оттенок фамильярности или насмешки. В советское время фамилия могла искажаться при переписи, но форма с «к» сохранилась именно в северных говорах.

В сословном отношении Ахтиманькины — почти наверняка крестьяне или однодворцы из бывших государственных крестьян. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Сегодня фамилия крайне редкая: по открытым данным, в России её носят не более нескольких десятков человек, в основном в Карелии и Архангельской области.