Фамилия Ахундзаде — яркий пример того, как восточная модель образования фамилий закрепилась на территории бывшей Российской империи, в первую очередь в Азербайджане и Иране. Её основа восходит к слову «ахунд» (или «ахун») — так в шиитском исламе называли учёного богослова, проповедника, духовного наставника, часто главу местной мусульманской общины. В некоторых тюркских диалектах слово могло означать и «господин», «учитель». Второй компонент — формант «-заде» персидского происхождения, буквально означающий «рождённый», «потомок». Таким образом, Ахундзаде — это «сын ахунда», «рождённый от духовного лица».

Модель образования фамилий через «-заде» широко распространена в азербайджанской, иранской, а также в среднеазиатской ономастике (ср. Мирзазаде, Гаджизаде, Векилзаде). В отличие от русских фамилий на «-ов/-ев», которые часто фиксировали принадлежность к отцу (Иванов — сын Ивана), персидский суффикс «-заде» подчёркивал не просто родство, а происхождение от человека определённого статуса или профессии. Носитель такой фамилии изначально указывал на свою сословную или профессиональную наследственность: дед или отец были религиозными авторитетами.

Интересно, что в Российской империи, особенно в Закавказье, фамилии на «-заде» нередко давались детям мулл и ахундов при записи в метрические книги, чтобы отличить их от простых крестьян. В советское время часть носителей фамилии Ахундзаде могла русифицировать её, отбросив окончание (став просто Ахундовым), но в Азербайджане и Иране форма с «-заде» сохранилась как маркер традиционного уклада.

Встречаются варианты написания: Ахунд-заде, Ахундзаде, а также Ахундов-заде, но основной и наиболее частотный — слитный, Ахундзаде. Фамилия не имеет отношения к тюркскому слову «ахун» в значении «староста» или «хозяин» — это омонимия, и богословская версия остаётся основной.