Фамилия Аксеров — редкий случай в русской ономастике, и интересна она прежде всего своим суффиксом. Большинство русских фамилий с окончанием -ов образованы от основ на твёрдый согласный: Иванов, Петров, Смирнов. Здесь же мы видим основу «Аксер» и суффикс -ов, что указывает на иноязычное происхождение корня. Фамилия явно не из частотных, и её носители, скорее всего, сосредоточены в определённых регионах, хотя точная география бытования не описана в общих справочниках.

Основа «Аксер» восходит к личному имени Аксель (скандинавское Axel) или к его тюркским вариантам, например, Ак-Сер (где «ак» — белый, благородный, а «сер» — голова, глава). В любом случае, это не славянское имя. Фамилия могла возникнуть у обрусевших потомков выходцев из Скандинавии, Прибалтики или тюркских народов. В русской среде имя Аксер (Аксель) могло превратиться в прозвище, а затем в фамилию, когда сына, внука или слугу человека по имени Аксер стали называть Аксеров — то есть «принадлежащий Акеру».

Сравнение с однокоренными фамилиями — Аксельрод, Аксельссон — показывает, что у Аксерова нет характерного для западных моделей суффикса -сон/-сен. Русский суффикс -ов «переварил» чужое имя, адаптировав его под привычную патронимическую модель. Если бы фамилия возникла в польской или украинской среде, мы бы, вероятно, увидели вариант Аксерский или Аксерин.

Версия о тюркском происхождении менее вероятна, но не исключена: в тюркских языках «аксер» может означать «белый воин» или «благородный вождь». Однако отсутствие фамилии в списках кавказских или татарских родов говорит скорее в пользу северного, скандинаво-балтийского следа. Сословная принадлежность первоносителей неясна — это могли быть и крестьяне, и мещане, и обрусевшие дворяне из Прибалтики. Точных данных об известных носителях фамилии в открытых источниках нет, что делает Аксеровых скорее редкой, чем распространённой фамилией.