Фамилия Альдонгарова — редкий пример тюркской фамилии с нетипичным для русского уха финальным элементом. Её основа почти наверняка восходит к тюркскому мужскому имени Альдонгар, которое, в свою очередь, состоит из двух частей: «ал» (красный, алый, либо герой, богатырь — в зависимости от диалекта) и «донгар» (фонетический вариант слова «тонгар» — «застывать», «коченеть»). В буквальном смысле имя могло означать «красный, как застывшая кровь» или «крепкий, как алый богатырь», но в быту, скорее всего, служило прозвищем человека с яркой внешностью или несгибаемым характером.

Словообразовательная модель здесь — классический тюркский патроним с русским суффиксом -ов. К имени Альдонгар прибавили сначала притяжательный аффикс в родительном падеже (Альдонгара — «сын Альдонгара»), а затем оформили по русской модели фамилий на -ов. Важно, что в основе стоит не женское имя: суффикс -ова указывает на принадлежность роду человека по имени Альдонгар, а не на происхождение от женщины.

Географически фамилия, скорее всего, привязана к регионам Поволжья или Урала, где издавна живут татары и башкиры. В среде этих народов имя Альдонгар встречается, хоть и нечасто, в старых метрических книгах. В русских говорах фамилия могла исказиться: на слух её нередко путают с более привычной Альдонгарова (с ударением на второй слог) или записывают как Алдонгарова, теряя мягкий знак.

В отличие от фамилий на -ин, которые в тюркской среде тоже возможны, Альдонгарова образована именно через -ов — это указывает на то, что предок носителя фамилии был крещён или его род попал в русскую административную систему в XVIII–XIX веках, когда фамилии оформляли по общероссийскому стандарту. Сословно носители могли быть как крестьянами, так и служилыми татарами, но точных данных о конкретных родах нет — фамилия слишком редкая, чтобы составить по ней обширную генеалогию.

Единственное, что можно сказать с уверенностью: Альдонгаровы — потомки человека, которого в своём окружении называли Альдонгаром. Значение этого имени, хоть и не до конца ясное, явно несло оттенок силы или яркой приметы.