Фамилия Алдонгарова — редкий пример, в котором русская словообразовательная форма (суффикс -ов) наложилась на нерусскую основу. Сразу бросается в глаза, что перед нами не типично славянская фамилия: корень «Алдонгар» явно тюркского или монгольского происхождения. Скорее всего, фамилию образовали от имени или прозвища Алдонгар, которое в свою очередь может восходить к сложению двух основ. Первая часть — «алд-» или «алты-» (тюрк. «алтын» — золото, или «алд» — передняя сторона, почётное место). Вторая часть — «-онгар» или «-ангар» (от тюркского «ангар» — просторный, широкий, или от монгольского «ангар» — трещина, расселина, а также название реки Ангара). Возможно, прозвище Алдонгар дали человеку, жившему у широкой реки или на открытом пространстве, либо обладателю «золотого» нрава или богатства.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия формировалась в русской языковой среде по модели «чей?» — то есть потомок Алдонгара. Окончание -а — признак женского рода, но в современном употреблении фамилия склоняется как по мужскому, так и по женскому варианту. Встречается она преимущественно среди народов Поволжья (татары, башкиры) и в казахской среде, где смешение тюркских корней с русским суффиксом — обычное явление в XIX–XX веках, когда происходила массовая фиксация фамилий. Именно в этот период при переписях и паспортизации многие нерусские прозвища записывали по русским шаблонам: к основе добавляли -ов или -ин, а женский вариант получал окончание -а. Так Алдонгар, бытовавший как личное прозвище, превратился в фамилию Алдонгарова.

Однокоренных фамилий немного. Можно вспомнить Алдонгаров (без суффикса женского рода) и, возможно, Алданов — но последний восходит к другому корню (от имени Алдан). В отличие от массовых фамилий вроде Иванов, Алдонгарова сохраняет прямую связь с конкретным прозвищем-основой, которое не превратилось в простое имя. Это редкий случай, когда исходное прозвище не стёрлось и не слилось с церковными или календарными именами, а осталось узнаваемым.

Исторический контекст: носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или казаками из южно-уральских или сибирских регионов, где тюркские и монгольские элементы смешивались с русским населением. Точных данных о сословной принадлежности нет, но редкость фамилии говорит о том, что родоначальник был заметной фигурой в своей локальной общине — иначе прозвище не закрепилось бы в документах. В записях XIX века такие фамилии часто встречаются среди тептярей и башкир Оренбургской губернии, где смешение языков и культур было нормой.