Фамилия Аленникова — женская форма фамилии Аленников, и её разбор показывает, что перед нами не один, а как минимум два возможных источника происхождения. Первый и самый очевидный связан с крестильным именем. В основе лежит народная форма имени Алексей (от греческого «защитник»), а иногда и Александр. В древности, когда ребёнку давали имя при крещении, в быту его могли называть уменьшительно — Аленя, Аленка. От этого прозвища и пошла фамилия.

Но есть и вторая версия, более редкая и географически привязанная. Суффикс -ник в фамилии Аленников (а значит, и в Аленникова) типичен для украинской и белорусской ономастики. В этих землях так называли человека по роду занятий или характерному признаку. Здесь возможна связь с прозвищем Олень. Под влиянием «аканья» (когда «о» без ударения звучит как «а») Оленник превратился в Аленника. В таком случае прозвище носило охранительный смысл: называя ребёнка Оленем, родители как бы поручали его природе, надеясь, что тот унаследует от зверя силу, быстроту или красоту.

Таким образом, фамилия Аленникова могла появиться двумя разными путями. Либо её привезли в Россию переселенцы с Украины или Белоруссии (носители фамилии Аленник), а затем русифицировали, добавив окончание -ов. Либо она возникла уже на русской почве как отчество от имени Ален (производного от Алексей). Что объединяет обе версии — это простое происхождение: предки Аленниковых, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, а не знатными людьми.