Фамилия Альфандери — редкий случай в русском ономастиконе. Её необычное звучание сразу выдаёт нерусское происхождение, и это как раз тот случай, когда фамилию не переделали на славянский лад, а сохранили в исходном виде. Основа фамилии — имя или прозвище, которое, скорее всего, восходит к итальянскому Alfanderi. В итальянском языке это патроним (фамилия по отцу) от имени Alfando — варианта германского Alfons (Альфонс), означающего «благородный и готовый к бою». Суффикс -eri в итальянских фамилиях часто указывает на принадлежность к роду или профессию, но здесь он выполняет роль патронимического окончания: «сын Альфандо».

География бытования фамилии подсказывает, что в Россию она попала не напрямую из Италии, а через посредничество греческого или южнославянского населения. В греческом языке фамилия могла писаться как Αλφαντέρης (Алфандерис) и означать выходца из местечка с похожим названием или потомка некоего Алфандера. Встречается она в основном на юге России — в Краснодарском крае, Ростовской области и среди греков Приазовья. Это не случайно: в XIX — начале XX века в эти регионы переселялись греки и понтийцы из Османской империи, среди которых были семьи с итальянизированными фамилиями — следы генуэзских и венецианских колоний в Крыму и Причерноморье.

Словообразовательная модель проста: фамилия не получила русского суффикса (-ов, -ин, -ский), а осталась «голой» основой. В русском языке такие фамилии склоняются по правилам существительных мужского рода на -и (Альфандери, Альфандери, Альфандери), но в быту их часто не склоняют вовсе, воспринимая как застывшую форму. Единственная морфологическая деталь — ударение: в русской традиции оно падает на последний слог (АльфандерИ), хотя в итальянском оригинале, возможно, стояло на втором (АльфАндери).

Споров о происхождении фамилии почти нет, потому что вариантов немного. Версия о чисто греческом корне (от αλφάδι — «уровень, ватерпас») маловероятна: слишком далека семантика, и фамилий от названий инструментов в греческом языке почти не образуют. Более убедительно выглядит связь с итальянским alfiere («знаменосец») через диалектное alfandiere — такое прозвище мог получить военный или глашатай. Но и это лишь гипотеза: письменных подтверждений перехода alfiere в Alfanderi в русских документах нет.

Сословная принадлежность носителей фамилии не прослеживается: Альфандери не значились в дворянских родословных книгах, не встречаются среди купеческих династий. Скорее всего, предки были ремесленниками, торговцами или крестьянами греческого происхождения, осевшими на южных рубежах империи. Фамилия осталась локальной, не разошлась широко по стране, и сегодня её носители — в основном потомки тех самых переселенцев.