Фамилия Алфутова — это прежде всего женская форма, но её смысл и происхождение раскрываются через мужской вариант Алфутов. В основе лежит редкое и неочевидное для современного уха слово. Чтобы понять корень, нужно отбросить суффикс -ов (указывающий на принадлежность) и посмотреть на основу «Алфут».

Здесь есть две основные версии, и первая — самая правдоподобная. Алфут — это искажённая, просторечная форма канонического крестильного имени Елевферий (от греческого «свободный»). В русском языке это имя давало целый ряд производных: Левтер, Лютор, Олфер, Алфер, Алфут. Так, через цепочку звуковых замен, имя «свободный» превратилось в прозвище Алфут. В говорах замена «ф» на «хв» (Алхутов) или «в» (Алвутов) тоже встречается, но «Алфутов» — один из самых устойчивых вариантов. Так что предок носительницы фамилии, скорее всего, был крещён как Елевферий, а в быту звался Алфутом.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая, связывает фамилию с тюркскими корнями. В ряде тюркских языков есть слова, близкие по звучанию к «алп» (богатырь, храбрец) или «алты» (шесть). Однако для фамилии Алфутова, которая распространена в центральных и южных регионах России, а не в зоне активного тюрко-славянского пограничья, тюркское происхождение выглядит натяжкой. Скорее всего, это позднее переосмысление уже славянизированного имени.

Словообразовательный суффикс -ов здесь стандартный для русских фамилий, образованных от полных форм прозвищ или имён. Он отвечает на вопрос «чей?»: сын Алфута. Интересно, что фамилия встречается и в варианте Алфутовский, что указывает на более позднюю, возможно, польскую или украинскую модель образования (суффикс -ский, указывающий на принадлежность к местности или роду), но это уже совсем другая история.

Таким образом, фамилия Алфутова — это памятник народной переработке церковного имени. Носительница этой фамилии может с уверенностью говорить, что её предок по мужской линии звался в быту Алфутом, что в переводе с греческого означало «свободный».