Фамилия Алифатдаева — редкий случай, когда географический и языковой анализ почти наверняка указывает на конкретный регион происхождения. Основа фамилии — мужское имя Алифатда. В нём соединились два компонента: «Али» (арабское «высокий», «возвышенный», одно из имён Аллаха) и «фатда» (искажённое «Фаттах» или «Фаттахуддин» — «победитель» или «открывающий врата»). Имена с двойной основой, где первая часть — «Али», характерны для мусульманских народов Северного Кавказа, особенно кумыков и народов Дагестана. Встречается и вариант Алипатда, где «п» появляется под влиянием кумыкского произношения.

Суффикс «-ева» — типичный русский патронимический показатель, который в XIX–XX веках добавляли к фамилиям горских народов при оформлении документов. Он означает принадлежность: «дочь Алифатды» или «из рода Алифатды». Таким образом, фамилия Алифатдаева — это русифицированный вариант отчества, закреплённый за женщиной (в мужском варианте было бы Алифатдаев).

Главная лингвистическая особенность — усечение конечного «-улла» или «-уддин», которое часто встречается в полных арабских именах (например, Алифаттах). В народной среде имя сократили до удобопроизносимой формы «Алифатда», отбросив «лишние» слоги. Это говорит о том, что фамилия сложилась в среде, где арабский язык не был родным, а имена заимствовались через устную традицию.

Носительницы фамилии Алифатдаева — почти исключительно женщины из кумыкских или аварских селений Дагестана (Хасавюртовский, Бабаюртовский районы). Учитывая, что фамилия образована от имени, а не от прозвища или профессии, предки, скорее всего, не имели сословных привилегий: такие фамилии получали крестьяне-общинники, чьи имена записывали в метрики русские чиновники. Других версий происхождения — от тюркского «алтын» («золото») или от арабского «алиф» («буква») — всерьёз рассматривать не стоит, так как они не объясняют ни суффикс, ни характерный для Дагестана слог «-фатда».