Фамилия Алиискендерова — женская форма; мужской вариант — Алиискендеров. Она стоит особняком среди русских фамилий, потому что её основа — не одно имя, а составное арабское имя Алискендер, где слились два значимых корня: Али («возвышенный», «великий») и Искендер — арабизированная форма имени Александр. На Востоке таким именем наделяли мальчиков, желая им соединить духовное благородство (Али) и воинскую доблесть Александра Македонского, известного в исламском мире как Искендер Зулькарнайн. Это пожелание величия и славы, зашифрованное в имени, и стало фамилией.

С точки зрения словообразования фамилия типична для народов Кавказа и Закавказья. В XIX–XX веках, при паспортизации, к местным именам присоединяли русский суффикс -ов/-ев, указывающий на принадлежность: «сын Алиискендера» или «из рода Алиискендера». Встречаются варианты написания: Алискендеров, Али-Искендеров, но форма Алиискендеров (с двойным «и») точнее передаёт состав имени — Али-и-скендер.

Географически фамилия чаще всего встречается среди азербайджанцев, лезгин и народов Дагестана. Носители фамилии — потомки людей, носивших это престижное имя. В крестьянской среде такое имя не давали случайно: оно могло быть знаком уважения к роду или данью моде на «книжные» имена, популярные среди мусульманского духовенства и торговцев. В отличие от простых отчеств вроде Иванов, здесь мы видим редкий случай «двойного корня», где каждое имя имело собственное значение, а вместе они образовывали сложную антропонимическую конструкцию, не имеющую отношения к русским словам «али» или «скендер».