Фамилия Алисин образована от женского имени Алиса. Это довольно редкий случай: обычно русские фамилии на -ин происходят от мужских имён или прозвищ, а здесь в основе лежит женское имя. Такое возможно, если ребёнок рос без отца или мать играла в семье главную роль — в деревнях таких детей могли записать по материнскому имени.

Само имя Алиса прошло долгий путь. Оно восходит к древнегерманскому Adalheid (позже — Adelheid), где adal означает «благородный, знатный», а heid — «вид, род, образ». Получается «благородная видом» или просто «благородство». В русский язык имя попало через французское посредничество, как сокращённая форма Adelaide. Есть и другие гипотезы: некоторые исследователи связывают Алису с греческим словом aletheia — «истина», или с именем Каллиста, но германская версия считается основной и подтверждена исторической лингвистикой.

Фамилия Алисин — притяжательная: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть «чей?» — «Алисин», то есть сын или потомок Алисы. По модели образования она стоит в одном ряду с фамилиями Марьин, Татьянин, Ольгин, но встречается реже, что делает её особенной. Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, родоначальницей была женщина по имени Алиса — возможно, вдова или мать, воспитавшая детей без мужа, что и закрепилось в фамильном прозвании.