Фамилия Алхаматова — женская форма фамилии Алхаматов, и её разумнее всего начинать не с суффикса, а с имени, которое легло в основу. Мужское личное имя Алхамат — это местный вариант арабского имени Ахмад, одного из эпитетов пророка Мухаммеда, означающего «достохвальный». Переход от «Ахмад» к «Алхамат» — типичное явление для тюркской и кавказской языковой среды: начальный звук «х» мог озвончаться или заменяться сходным, а гласные менялись под влиянием местных диалектов. Таким образом, в основе фамилии лежит не прозвище, не ремесло, а именно мужское личное имя, популярное у мусульманских народов.

Суффикс -ов (в женском варианте -ова) указывает на стандартную русскую модель образования фамилий от имён или прозвищ по принципу «чьим сыном был?» — Алхаматов. Эта модель массово закреплялась у народов Северного Кавказа и Закавказья в XIX–XX веках, когда при документальном оформлении фамилий использовали русские патронимические суффиксы. Среди носителей фамилии Алхаматова действительно много чеченцев, ингушей, кумыков и аварцев, а географически она чаще всего встречается в Чечне, Дагестане и в среде чеченской диаспоры.

Интересная деталь, которая отличает эту фамилию от многих других: она могла возникнуть как русифицированная форма чеченской фамилии, образованной с помощью национального суффикса -ой. В чеченском языке фамилии часто строятся именно так, но при записи в российских документах их «подгоняли» под стандартный -ов. Поэтому носители фамилии Алхаматова могут принадлежать к одному из чеченских тейпов, где имя Алхамат было родовым.

Другие версии происхождения маловероятны. Например, попытка связать фамилию с тюркским «ал» (красный, алый) и «хамат» (как вариант «хозяин») не выдерживает критики: имя Алхамат — устойчивая антропонимическая форма, а не описательное прозвище. Фамилия не имеет отношения к славянским корням или к географическим названиям.