Фамилия Аллаберганова — тюркская по происхождению, а точнее, восходит к огузской или кыпчакской языковой среде. В её основе лежит арабское имя Аллаберган, которое переводится как «Богом данный» или «дарованный Аллахом». Это типичное для мусульманских народов теофорное имя, то есть имя, содержащее указание на Бога. Форма «берган» — это причастие от глагола «бермек» (давать) в тюркских языках, так что имя буквально означает «Аллах дал».

Фамилия образована по русской модели: к имени Аллаберган добавили патронимический суффикс -ов, а затем — женское окончание -а. То есть Аллаберганова — это «дочь (или жена) Аллабергана». Такая модель типична для фамилий народов Поволжья, Северного Кавказа и Средней Азии, которые в XIX–XX веках фиксировались в русских документах. Мужской вариант фамилии — Аллаберганов.

Географически фамилия чаще всего встречается среди туркмен, узбеков, каракалпаков, а также у татар и башкир. В России носители фамилии сосредоточены в Астраханской области, Дагестане и Татарстане — регионах с давними тюркскими общинами. Интересно, что в отличие от многих арабских имён, которые пришли через ислам, Аллаберган — это именно местная, тюркская переработка: здесь арабское «Аллах» соединилось с тюркским глаголом, а не с арабским корнем.

Сословно носители фамилии в основном были крестьянами или ремесленниками, но встречались и среди духовенства — муллы и учителя медресе нередко носили имена с частицей «Алла». Поскольку фамилия произошла от личного имени, а не от прозвища или профессии, она не даёт прямых указаний на род занятий предка, зато точно говорит о его вероисповедании — исламе суннитского толка.