Фамилия Аллакин — одна из тех, где корень ведёт в тюркские языки, но точное значение исходного прозвища или имени остаётся предметом спора. Скорее всего, в основе лежит имя Аллак. Его возводят к тюркскому слову «аллаку» — «сияющий», либо к «алака» — «посол, пророк». Оба варианта дают прозвище с положительным оттенком: так могли назвать заметного, яркого человека или того, кто выполнял важные поручения, был посредником.

Однако есть и другая версия, прямо противоположная по смыслу. Согласно ей, прозвище Аллак образовано от турецкого allak — «ненадёжный», «обманщик, лжец». Такая двойственность не редкость в народной ономастике: одно и то же звучание могло закрепиться за разными качествами — и за достоинством, и за пороком. Какая из гипотез правдоподобнее, сказать трудно без привязки к конкретному региону бытования фамилии: в южнорусских и поволжских говорах, где было сильно тюркское влияние, могли прижиться оба варианта.

Сама фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин. Он указывает на принадлежность: Аллакин — «сын Аллака» или «человек из рода Аллака». Фамилия редкая, в дореволюционных переписях почти не встречается, что говорит о её позднем оформлении или локальном распространении. Среди однокоренных можно назвать Аллаков, Аллак — обе встречаются у тюркоязычных народов, но в русской среде закрепилась именно форма на -ин.