Фамилия Аллин — редкий случай метронимической фамилии, то есть образованной не от имени отца, а от имени матери. В русской традиции такие фамилии давали, если женщина играла ключевую роль в хозяйстве, была вдовой или её имя было более значимым для окружения, чем имя мужа.

Основа фамилии — женское имя Алла. В переводе с греческого оно означает «вторая», «другая» или «следующая». Покровительницей имени считается мученица Алла, день памяти которой приходится на 8 апреля (26 марта по старому стилю). Существует и другая версия: имя Алла могло быть вариантом мусульманского мужского имени Аллах, что значит «бог», но для русской ономастики эта гипотеза менее правдоподобна — фамилия закрепилась в славянской среде, где такое прямое заимствование маловероятно.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Аллин — «чей?» — сын Аллы. По этой же модели образованы массовые русские фамилии вроде Марьин, Катин, Танин. Таким образом, предок носителя фамилии Аллин — человек, которого в быту называли по матери: «Аллин сын», а со временем это прозвище закрепилось как родовая фамилия.

Фамилия нечастотная. Встречается в основном в центральных и южных регионах России, а также среди потомков переселенцев. Из-за редкой основы её иногда путают с фамилией Аллин, ведущей начало от мужского имени Алла (в тюркских языках) или от фамилии Аллин, образованной от прозвища Алый — но это разные корни.

Несмотря на кажущуюся простоту, фамилия Аллин — яркий пример того, как в русском быту фиксировали женскую линию, что встречается реже, чем отчества от мужских имён.