Фамилия Алыко — редкий случай, когда суффикс указывает на географию точнее, чем корень. В русской ономастике фамилии на -ко (Алыко, Грицко, Федько) типичны для Украины и Беларуси: это уменьшительно-ласкательная форма имени или прозвища, застывшая в документах XVI–XVII веков. Сама основа Алы- — спорная.

Первая и самая вероятная версия: Алыко — это производное от канонического имени Алексей в его народной, усечённой форме. В южнорусских и украинских говорах «Алексей» превращалось в «Алёша», «Алесь», а затем в «Аль» или «Алык» — с характерным для тех мест окончанием. Суффикс -ко здесь работает как показатель родства или принадлежности: буквально «маленький Алык», «сын Алыка». Модель типичная: имя → прозвище → фамилия.

Вторая версия, менее распространённая, — связь с тюркским корнем. В языках тюркской группы «алык» означает «большой, могучий» или «сильный». Если предок носителя фамилии жил на южных рубежах России, где контакт с тюркским населением был плотным, прозвище Алык могло характеризовать физическую силу или статью. Однако для славянской фамильной модели это нетипично: в тюркских языках фамилии на -ко не образуют, так что скорее тюркское слово легло в основу прозвища, а уже его «ославянили» суффиксом.

Третья версия — отчество от имени Алык как краткой формы Альберт или Альфред. Но эти имена вошли в русский обиход поздно, в XIX–XX веках, поэтому для старинной фамилии такое объяснение маловероятно.

Географически фамилия Алыко встречается почти исключительно на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в приграничных районах Беларуси. В центральной России она редка, что подтверждает её украинско-белорусское происхождение. Сословного барьера у неё не было: носителями могли быть и крестьяне, и казаки, и мещане — суффикс -ко одинаково часто встречается во всех слоях.

По написанию фамилия устойчива: варианты «Алико» или «Алыка» встречаются, но как ошибки паспортистов. Ударение, скорее всего, падает на первый слог — А́лыко, хотя в украинском произношении возможен второй вариант.