В основе фамилии Алышанов лежат тюркские мужские имена Алыш, которое в переводе на русский язык означает «добыча, приобретение» и Ана - «мама». Однако в татарском языке есть выражение «алыш-биреш», то есть «купля-продажа». Таким образом, в основе этой фамилии может лежать прозвище Алыш, которое мог получить торговец. Наконец, в переводе с киргизского это слово означает «большой арык, отводный магистральный канал».