Фамилия Амакасов — редкая и, по всей видимости, поздняя по происхождению. Её основа, суффикс и ареал бытования указывают на то, что перед нами, скорее всего, не древняя боярская или крестьянская фамилия центральной России, а искусственное образование, возникшее в среде духовенства или в результате канцелярской записи в XIX веке.

Разберём её по составу. Суффикс -ов — стандартный русский патронимический показатель, указывающий на принадлежность («чей?»). Основа — Амакас. Это не крестильное имя, не прозвище из русского быта и не тюркское слово, легко поддающееся переводу (в отличие, например, от фамилий на «-бай» или «-бек»). Наиболее правдоподобная версия: Амакас — это искажённая или сокращённая форма библейского имени или географического названия.

В ономастике известен случай, когда фамилии семинаристов образовывали от названий церковных праздников или имён святых, нередко в латинизированной или грецизированной форме. Имя Амос (древнееврейское «несущий бремя») в греческом произношении могло дать форму «Амакос» или «Амакас». Сравните: известная фамилия Амакосов (или Амакасов) могла возникнуть в среде выпускников духовных училищ, где будущим священникам давали «благозвучные» фамилии по названию храма или по имени почитаемого пророка. Версия не бесспорна, но она объясняет и редкость, и книжный, «кабинетный» характер фамилии.

Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит тюркское имя Амак (встречается у татар и башкир) с добавлением русского суффикса -ас (как в фамилиях Кудасов, Буласов). В этом случае «Амакас» — русифицированная форма отчества от имени Амак. Однако фамилии на -асов чаще встречаются в Поволжье, а Амакасов — фамилия, распространённая, судя по скудным данным, скорее в центральных областях России, что склоняет чашу весов в пользу «семинарской» версии.

Географически фамилия Амакасов встречается крайне редко, в основном в единичных записях по Московской и соседним областям. Это подтверждает её «штучный» характер: она не разошлась широко по крестьянским общинам, а осталась в пределах одной-двух семей, возможно, потомков одного священника или дьячка.