Фамилия Амеркенова — яркий пример фамилии, образованной по тюркской модели. Её основа — имя Амеркен, которое, скорее всего, восходит к арабскому Амир (повелитель, князь) с добавлением тюркского компонента -кен (от «кен» — широкий, просторный, или как уменьшительно-ласкательный суффикс). Таким образом, Амеркен может означать «маленький повелитель» или «широкий (щедрый) амир». Это имя-пожелание, популярное у казахов, татар, башкир и других тюркских народов.

Суффикс -ова указывает на принадлежность: Амеркенова — дочь или жена человека по имени Амеркен. Это типичная патронимическая фамилия, которая закрепилась в русской официальной среде в XIX–XX веках при записи в метрические книги или советские паспорта. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, где ударение часто падает на суффикс, в фамилиях тюркского происхождения ударение обычно сохраняется на основе: Амеркéнова.

Географически фамилия распространена в Казахстане, а также среди казахских диаспор в России (Оренбургская, Астраханская области) и в Средней Азии. Встречается и вариант написания с одной «н» — Амеркенова, но это редкость, так как исходное имя пишется через двойное «н» в русской транскрипции.

Словообразовательный разбор показывает, что фамилия не связана с ремёслами, прозвищами или топонимами. Это чисто именная фамилия, возникшая в среде кочевников-скотоводов, где личное имя несло главную смысловую нагрузку. Никаких спорных этимологий здесь нет: корень прозрачен, а модель образования — одна из самых массовых в тюркском ономастиконе.