Фамилия Амеркенова — пример того, как тюркское личное имя закрепилось в русской официальной форме. Её основа — мужское имя Амеркен, которое, скорее всего, сложилось из двух частей: арабского Амир (повелитель, князь) и тюркского компонента -кен. В тюркских языках «кен» может означать «широкий, просторный» или выступать как уменьшительно-ласкательный суффикс. Отсюда две возможные трактовки имени: «маленький повелитель» или «щедрый (широкий) амир». Это типичное имя-пожелание, популярное у казахов, татар, башкир и других тюркских народов.

Суффикс -ова в фамилии указывает на принадлежность: Амеркенова — дочь или жена человека по имени Амеркен. Это патронимическая модель, которая массово закреплялась в XIX–XX веках, когда тюркские имена записывали в метрические книги и советские паспорта по русскому образцу. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, где ударение часто падает на суффикс, здесь оно сохраняется на основе: Амеркéнова.

Словообразовательный разбор показывает, что фамилия не связана с ремёслами, прозвищами или географическими названиями. Это чисто именная фамилия, возникшая в среде кочевников-скотоводов, где личное имя несло главную смысловую нагрузку. Никаких спорных этимологий здесь нет: корень прозрачен, а модель образования — одна из самых массовых в тюркском ономастиконе.

Географически фамилия распространена в Казахстане, а также среди казахских диаспор в России — особенно в Оренбургской и Астраханской областях, и в Средней Азии. Встречается и вариант написания с одной «н» — Амеркенова, но это редкость: в русской транскрипции исходное имя обычно передают через двойное «н».