Фамилия Анаприенко — не случайный набор звуков, а чёткий паспорт, указывающий на украинское происхождение. Её основа — народное имя Анаприй, которое появилось как упрощение канонического крестильного имени Онуфрий (церковнославянская форма греческого имени, означающего «священный бык» или «святой»). В украинской разговорной среде начальное «О» заменилось на «А» (явление аканья, свойственное южным говорам), а середина слова стянулась: Онуфрий → Онупрій → Анапрій. Так родилось прозвище, которое и легло в основу фамилии.

Суффикс -енко — самый узнаваемый маркер украинской ономастики. В XVI–XVIII веках он массово закреплялся за казаками и крестьянами Левобережной и Слободской Украины и буквально означал «сын» или «потомок». Анаприенко — это «сын Анаприя». Такую фамилию носил человек, чьего отца или деда в миру звали не полным церковным именем, а обиходным Анаприй.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины: Полтавщина, Черкащина, Сумщина. Оттуда вместе с потоками переселенцев она попала на Кубань и в Ростовскую область — регионы, где оседали украинские казаки. В России иногда встречается русифицированный вариант Анаприенков, но исходная форма с суффиксом -енко остаётся преобладающей.

Спорные версии иногда выводят фамилию из греческого «анаприо» (перепиливать) или из тюркских корней. Эти гипотезы неубедительны: они требуют слишком много допущений. Гораздо логичнее и проже объяснение через имя Онуфрий, которое в украинской среде дало целое гнездо родственных фамилий: Анаприйчук (суффикс -ук/-чук типичен для запада Украины), Анаприев, Анаприй, Анаприенко. Все они однокоренные и различаются только региональными суффиксами.

Таким образом, Анаприенко — не редкая аномалия, а типичный представитель большой группы украинских фамилий на -енко, чьи предки носили имя Онуфрий в его народной форме.