Фамилия Анегдин, скорее всего, образована от имени Анегда, которое представляет собой производную форму имени Анект. Оно в переводе с греческого языка на русский означает «сносный, терпимый». Известно два покровителя этого имени: мученик Анект, поминаемый 23 марта, а также мученик Анект Кесарийский, день памяти которого приходится на 10 июля. Таким образом, потомок человека, которого звали Анегда, со временем получил фамилию Анегдин.