Фамилия Аннинская образована от прозвища Аннинский, которое, вероятно, восходит к названию местностей: Анненка, Аннинское, Аннинский Лозовец, Ново-Аненское и т.п. Села с подобными названиями есть в России и на Украине. Не исключено, что поселения с подобными названиями существовали ранее в других регионах. Вероятно, название местностей восходит к имени каноническому женскому имени Анна. Это имя было очень популярно на Руси. В православных святцах оно упоминается более тридцати раз. Вероятно, выше указанные поселения названы так, поскольку в них была церковь, построенная в честь одной из святых по имени Анна. Однако не исключено, что поселения названы по имени их владелицы. Некоторые исследователи полагают, что фамилия Аннинский имеет искусственное происхождение и относится к числу семинарских фамилий. Такие фамилии возникали в случаях: когда к моменту поступления в семинарию человек еще не имел официально закрепившейся фамилии, а ее, тем не менее, требовалось указать в документах; когда естественно сложившаяся фамилия будущего церковнослужителя ассоциировалась с неподобающими сану вещами (например, Пьянов, Разгуляев и т.п.); когда семинарские наставники желали поощрить одаренных учеников, присвоив им красивое именование; когда требовалось наказать нерадивых семинаристов, заставив их носить фамилию, образованную от слова с негативным значением. В данном случае фамилия Аннинский могла быть дана семинаристу в честь одной из святых Анн или же по названию Аннинской церкви. Среди известных однофамильцев можно выделить советского и российского литературного критика, писателя Льва Александровича Аннинского. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Аннинский, со временем получил фамилию Аннинская.