Фамилия Антипипин сразу привлекает внимание необычным двойным суффиксом «-ип-ин». В русских фамилиях такая модель встречается редко и обычно указывает на сложный путь образования: либо это народная переделка, либо фамилия происходит от прозвища, уже имевшего свой суффикс. В отличие от распространённых Антиповых и Антипиных, Антипипин — редкий случай, когда патроним «нарастили» дополнительным звуком.

Основа фамилии — крестильное имя Антип (от греческого «противник»). От него образованы десятки фамилий, но Антипипин — это Антипа плюс «-ип-» плюс «-ин». Вторая часть «-ип-» могла возникнуть из диалектной формы имени: в некоторых говорах Антипа произносили как Антипий, отсюда и основа Антипип-. То есть фамилия буквально значит «сын Антипия» или «потомок того, кого звали Антипой» с наращением звука. Такой же словообразовательный ход встречается в фамилиях Вавилипин и Филипипин, где к основе на -а/-я добавляли ещё один суффикс, чтобы отчётливее выделить патроним.

Другая версия — прозвищная. В северных и сибирских говорах бытовало слово «антипка» (черт, бес, нечистая сила), а «антипип» могло быть его искажением или ласкательной формой. В таком случае фамилия — от мирского прозвища, данного в охранительных целях или по поведению.

Географически фамилия редкая, встречается точечно в Вологодской, Кировской областях и в Зауралье. В метрических книгах XVIII–XIX веков можно найти единичные записи — например, крестьяне Антипипины из Сольвычегодского уезда. Дворянских родов с такой фамилией нет: это стопроцентно крестьянская или мещанская среда, где фамилия закрепилась в устной традиции и не прошла через канцелярскую унификацию. В современном русском языке фамилия звучит громоздко, но для своего времени была обычной «уличной» формой, отличавшей одну семью от соседей Антиповых.