Фамилия Апалонский — редкий случай, когда написание зафиксировало не книжную норму, а живую народную речь. На слух она почти неотличима от «Аполлонский», и это не случайность: в её основе лежит имя древнегреческого бога Аполлона. Однако написание через «а» в первом слоге — не ошибка, а отражение того, как имя Аполлон произносили и записывали в русских говорах: как Апалон. Именно от этого разговорного, а не церковнославянского варианта и пошла фамилия.

Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ск- указывает на принадлежность. Фамилии на -ский в России чаще всего носили дворяне, духовенство или выходцы из определённой местности. Но в случае с Апалонским наиболее вероятен семинарский путь. В духовных училищах XVIII–XIX веков будущим священникам нередко давали «благозвучные» фамилии, образованные от имён античных богов или героев. Аполлон — бог искусств, света и врачевания, так что фамилия могла быть присвоена семинаристу, чтобы подчеркнуть его образованность или принадлежность к церковной среде.

Второй, более прозаичный вариант — фамилия могла возникнуть от прозвища Апалон. Так в народе могли называть статного, красивого мужчину, похожего на античного бога, или же человека с каким-то особенным, «божественным» талантом — певца, музыканта, поэта. Прозвища такого рода были не редкостью в крестьянской среде, где ироничное или восхищённое сравнение с мифологическим персонажем закреплялось за человеком и передавалось потомкам.

Географически фамилия Апалонский встречается редко, что подтверждает её искусственное или локальное происхождение. Она не имеет массового распространения, как, скажем, Иванов или Кузнецов, и чаще всего фиксируется в центральных и южных регионах России, а также среди потомков духовенства. Встречаются и варианты написания — Аполлонский, Аполонский, но именно форма с «а» в первом слоге — наиболее любопытная, так как она сохранила живое произношение, а не книжную норму.

Таким образом, носитель фамилии Апалонский может с равной вероятностью оказаться потомком либо семинариста, получившего «красивое» имя при поступлении в училище, либо человека, которого в деревне прозвали Апалоном за стать или дарование. В любом случае, фамилия эта — редкий след античной культуры, переработанной русским языком и бытом.