Фамилия Апицын образована от имени собственного и относится к распространенному типу ненецких фамилий. Фамилия Апицын образована от имени Апица, которое распространено у народов севера, в частности ненцев. Согласно одной из версий, имя Апица связано с именем скифской богини воды – Апи. фамилия Апицын впервые упоминается в документах Пустозерского воеводы в 1517 году.