Фамилия Аплеухин — редкий случай, где исходное слово почти стёрлось из живого языка, но чётко восстанавливается по словообразовательной модели. Основа здесь — «аплеух», а суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — сын или потомок Аплеуха. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, и говорит о том, что предок носителя фамилии был известен в своей общине под этим прозвищем.

Корень «апле-» с большой вероятностью восходит к диалектному или устаревшему «оплеуха» — пощёчина, удар по щеке. В говорах слово могло звучать как «аплеуха» (с аканьем, распространённым в южнорусских и среднерусских областях). Прозвище Аплеух, таким образом, могли дать человеку либо за драчливый нрав, либо, наоборот, за то, что он сам часто получал оплеухи. В ономастике такие «обидные» прозвища нередко закреплялись за родом и теряли негативный оттенок уже в следующем поколении.

Менее вероятна, но всё же возможна версия о связи с тюркскими языками. В некоторых тюркских наречиях «апле» или «аплы» могло означать «старший брат» или «уважаемый человек», но эта гипотеза слабее: суффикс «-ух» в русских прозвищах (ср. Грязнуха, Толстуха) типичен именно для славянской модели, а не для заимствований. Поэтому версия с «оплеухой» остаётся основной.

Географически фамилия Аплеухин встречается в основном в центральных и южных регионах России — в Воронежской, Тамбовской, Ростовской областях. Это подтверждает акающий говор, который превратил «оплеуху» в «аплеуху». В северных и сибирских регионах фамилия почти не фиксируется.

Социальный контекст прост: прозвище Аплеух носил, скорее всего, крестьянин или посадский человек. Фамилии на «-ин» от прозвищ в XVI–XVII веках были массово распространены среди крестьянства, и Аплеухин — типичный пример такой фамилии, без дворянских или боярских корней. Известных носителей в истории не зафиксировано, что делает фамилию чисто народной, без громких страниц, но с живым бытовым корнем.