Фамилия Аталыковы ведёт своё начало от тюркского прозвища Аталык, которое в переводе с тюркского «atalyq» означает «воспитатель». Так называли человека, которому доверяли воспитание детей — часто в знатных семьях. Следовательно, родоначальник Аталыковых мог быть наставником или опекуном, что в тюркском обществе считалось почётной и ответственной ролью.

Слово «аталык» образовано от тюркского «ата» — «отец», с добавлением суффикса «-лык», который придаёт значение качества или должности. Таким образом, аталык — это «тот, кто выполняет отцовскую роль», замещает отца в воспитании. Подобные имена-прозвища были распространены у тюркских народов, особенно в среде знати, где детей нередко отдавали на воспитание в другую семью, чтобы укрепить союз между родами.

Фамилия Аталыковы относится к распространённому типу восточных фамилий, которые вошли в русскую ономастику через выходцев из Золотой Орды, а также через печенегов и половцев. В XV–XVII веках, когда русское дворянство активно пополнялось за счёт служилых людей тюркского происхождения, многие такие прозвища закрепились как фамилии. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от тюркских основ: Аталык → Аталыков — «сын (или потомок) Аталыка».

Примечательно, что фамилия Аталыковы встречается в нескольких регионах, но особенно характерна для Поволжья и Урала, где исторически сильны тюркские корни. Среди известных носителей фамилии — представители татарских и башкирских родов, что подтверждает её происхождение. В отличие от многих фамилий, чья этимология спорна, здесь основа ясна: прозвище Аталык не оставляет сомнений в занятии предка.