Фамилия Аткеева — женская форма фамилии Аткеев, и её происхождение почти наверняка ведёт в тюркские языки, скорее всего, в казахский, башкирский или татарский. Основа «Атке» или «Аткей» — это личное имя, которое образовано от тюркского слова «ат» (конь, лошадь) с добавлением уменьшительно-ласкательного аффикса «-кей» или «-ке». Буквально имя Аткей можно перевести как «конёк» или «лошадка» — в переносном смысле так могли назвать быстрого, резвого ребёнка или того, кто с детства хорошо управлялся с лошадьми.

Словообразовательная модель проста: к основе Аткей добавили русский патронимический суффикс «-ев», который в тюркских фамилиях часто присоединяли к именам, заканчивающимся на согласный или «й». Таким образом, Аткеев — это буквально «сын Аткея», а Аткеева — его потомок по женской линии. Суффикс «-ев» здесь типичен для фамилий, возникших в среде, где русское делопроизводство оформляло тюркские имена по своим правилам. Важно, что в самой тюркской среде фамилия не могла появиться — там патронимов на «-ев» не было, это чисто русская канцелярская форма, закреплённая в документах XIX века. Поэтому женская форма Аткеева не имеет собственной исторической глубины: она возникла как грамматический вариант в паспортной системе и метрических книгах, где женские фамилии образовывали от мужских простой заменой окончания.

Географически фамилия Аткеева встречается в регионах с компактным проживанием тюркских народов: в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской области, а также в Казахстане. Встречаются носители и на Северном Кавказе, что может указывать на ногайские или кумыкские корни, где имя Аткей также зафиксировано. Среди носителей фамилии выделяется, например, казахстанская легкоатлетка Ольга Аткеева, специализирующаяся на спортивной ходьбе, что подтверждает тюркское происхождение и современное бытование фамилии. В целом фамилия довольно редкая, и её не стоит путать с похожими Аткеевыми или Аткеновыми — они могут иметь разные основы, например, от имени Аткен (от «ат» + «кен» — широкий, просторный). Разница в суффиксе меняет значение: если Аткеев — «сын конька», то Аткенов — «сын широкого коня», что звучит как прозвище, а не ласковое имя.