Фамилия Атлигишиев — одна из тех, что сразу приковывает внимание своей необычной длиной и редким звучанием. Она почти наверняка имеет тюркское или кавказское происхождение, скорее всего, кумыкское или ногайское. В основе лежит составное личное имя или прозвище, которое можно разделить на две части: «Атлы» и «Гиши».

Первая часть, «атлы», в тюркских языках означает «конный», «всадник», «имеющий лошадь». Вторая часть, «гиши» (или «гишиев»), — это вариант слова «киши», то есть «человек», «мужчина». Таким образом, имя Атлыгиши (от которого и образована фамилия) буквально переводится как «конный человек» или «всадник». Это могло быть прозвищем, данным искусному наезднику, воину или человеку, чья жизнь была тесно связана с лошадьми.

Модель образования фамилии — русский патронимический суффикс «-ев», добавленный к тюркской основе. Это типично для фамилий, которые оформились у народов Северного Кавказа и Поволжья в XIX–XX веках, когда при переписях и в документах к местным именам приписывали русские окончания. В данном случае исходная форма — Атлигиши, а фамилия означает «потомок Атлигиши».

Географически фамилия Атлигишиев редка и встречается почти исключительно среди кумыков и ногайцев, в основном в Дагестане и Ставропольском крае. Встречаются варианты написания с одной «и» — Атлигишев, что связано с особенностями произношения и записи тюркских имен в русской транскрипции. Родственных фамилий, таких как Атлыгишиев или Атлыгишев, в источниках не зафиксировано, что подчеркивает уникальность этой фамилии и её связь с конкретным родом или семьей.