Фамилия Атлигишиева — редкий случай, когда географическая привязка почти очевиднее, чем корень. Её носительницы почти наверняка из Дагестана, а сама фамилия прошла через русскую грамматическую обработку: исходная мужская форма — Атлигишиев, женская образована стандартным прибавлением -а. Суффикс -ев указывает на патронимическую модель: фамилию сделали из имени отца, добавив русский суффикс к основе на -и.

Основа «Атлигиши» в русском языке не имеет значения — это транслитерация местного имени или прозвища. Скорее всего, оно восходит к тюркскому или кумыкскому имени Атлыгиши. Разбираем: «атлы» в тюркских языках означает «конный», «всадник», а «гиши» (или «киши») — «человек», «мужчина». Получается «человек на коне», «конный воин». Такое имя-прозвище мог получить лихой наездник, воин или человек, чья служба или ремесло были связаны с лошадьми. В кумыкской и ногайской традициях составные имена, описывающие внешность, род занятий или характер, не редкость.

Модель образования фамилии проста: к основе Атлигиши добавили русский патронимический суффикс -ев (вариант -ов после шипящих и мягких согласных, но здесь основа на -и, поэтому -ев). В Дагестане, особенно у кумыков и народов, испытавших тюркское влияние, фамилии на -ев и -ов массово фиксировались в XIX–XX веках при оформлении документов. Форма Атлигишиева — скорее всего, вариант записи, где тюркское «ы» заменилось на «и» при русификации. Других версий, например арабского или персидского корня, практически нет: слово «атлы» — маркер именно тюркской лексики.

Сословной принадлежности предков по фамилии не определить: «всадник» мог быть и узднем (дворянином), и простым пастухом. Но само имя указывает на уважаемое качество — ловкость и связь с конём, что в горской культуре ценилось высоко. Если искать аналоги, можно вспомнить кумыкскую фамилию Атлыгишиев — она встречается в республике, хоть и нечастотна.