Фамилия Атоманова — женская форма фамилии Атоманов, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. В ней слышится что-то «атаманское», но это скорее народное переосмысление, чем истинный корень. На самом деле фамилия образована от прозвища или имени Атоман, которое в свою очередь восходит к тюркскому слову «атаман» — «старшина, предводитель». Однако в русской ономастике закрепилась форма не с «а», а с «о» в первом слоге, что указывает на акающее произношение. То есть исходное слово звучало как «атаман», но в бытовой речи, особенно в южнорусских и казачьих говорах, его произносили через «о», а потом так и записали.

Суффикс «-ов» типичен для русских фамилий, указывая на принадлежность к роду: Атоманов — сын или потомок Атомана. Так могли прозвать человека, который был выборным старшиной, казачьим атаманом, или же того, кто отличался властным, командирским нравом, даже если формально не занимал должности. В некоторых случаях прозвище давали иронически — например, заносчивому или любящему командовать крестьянину.

Есть и другая, менее распространённая версия: фамилия могла произойти от имени Атом, которое встречалось у тюркских народов, а затем обрусело. Но прямых подтверждений этому мало, и большинство исследователей склоняются к связи с «атаманом». В пользу этой версии говорит и география фамилии: она чаще встречается в Ростовской области, Краснодарском крае и на Дону — в тех регионах, где казачество было основой населения.

В архивных записях фамилия Атоманов фиксируется с XVIII века среди донских казаков. Например, в ревизских сказках Войска Донского за 1763 год упоминается казак Иван Атоманов — это одно из ранних свидетельств. Таким образом, носители фамилии Атоманова, скорее всего, потомки вольных людей, чей предок носил прозвище, отражавшее либо его реальный статус, либо характер.