Фамилия Атюнина, вероятно, восходит к прозвищу Атюн, которое образовано от украинского междометия «атю» - «бери, лови». Вероятно, так прозвали псаря, ловца, охотника. В некоторых говорах подобным образом называли отца. Например, в Тульской области «атька», «атя», «атенька» - это «папа, отец, батюшка». Согласно еще одной гипотезе, фамилия Атюнина имеет западноевропейское происхождение и связана с английским attune – «делать созвучным, настраивать». Возможно, что предок обладателя данной фамилии был музыкантом или настройщиком. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Атюн, со временем получил фамилию Атюнина.