Фамилия Атюнин, вероятно, представляет собой фонетический вариант фамилии Отюнин, возникший под влиянием «акающих» говоров. Эта фамилия, скорее всего, связана с названием поселения Отюнь, расположенного в Ленинградской области близ города Павловск. Предположительно название Отюнь имеет финно-угорское происхождение и восходит к корню «от», что значит «широкий», или «ота» - «роща». В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Отюнин, со временем получил фамилию Атюнин.