Фамилия Авдюха — один из тех случаев, когда происхождение не вызывает споров, а корень лежит на поверхности. В основе лежит разговорная форма крестильного имени Авдий. С древнееврейского это имя переводится как «слуга Бога» или «служитель Господа». В русском быту, особенно в южных и западных регионах, имя Авдий переделывали в более короткое и удобное Авдя, а затем добавили ласкательный суффикс -юха, характерный для украинской и белорусской традиции. Тот же суффикс мы видим в неофициальных именах и прозвищах вроде Матюха или Михлюха. Таким образом, Авдюха — это, скорее всего, прозвище человека, которого в семье или среди соседей звали ласково или фамильярно. Со временем это прозвище закрепилось за его потомками как фамилия.

Модель образования здесь — без суффикса -ов/-ев или -ин, то есть фамилия осталась в начальной форме. Это типично для украинских и белорусских фамилий: сравните Шевченко, Коваль, Гаврилюк. В русском ономастиконе такие фамилии встречаются реже, но встречаются, особенно на территориях, где долго жили переселенцы из Малороссии или где было сильное влияние польско-литовской культуры. Именно поэтому Авдюха — не усечённая форма от Авдюхин, а самостоятельная фамилия с нулевым окончанием, что подчёркивает её южнорусское или украинское происхождение.

По сословной принадлежности определённо сказать сложно: фамилия могла возникнуть как у крестьян, так и у казаков или мещан. В документах XVII–XVIII веков на юге России и в Слобожанщине имя Авдюха фиксируется именно как личное прозвище. Сегодня фамилия Авдюха встречается в основном на Украине, в Беларуси, а также в приграничных областях России — Брянской, Курской, Ростовской. Других версий происхождения, кроме связи с именем Авдий, нет — корень прозрачный, и это единственное логичное объяснение.