Фамилия Авдюхова образована от народной формы крестильного имени Авдей. Полное церковное имя — Авдий, оно пришло из древнееврейского языка и означает «служащий Богу». В быту это имя часто сокращали и переделывали на русский лад: так появились формы Авдюк, Авдюх, Авдюша. Именно от одного из таких обиходных вариантов — Авдюх — и пошла фамилия.

Суффикс -ов в окончании указывает на типичную модель русских фамилий: он присоединялся к основе, отвечая на вопрос «чей?». То есть Авдюхов — это «сын Авдюха» или, шире, «потомок того, кого звали Авдюх». Такая модель была особенно распространена среди крестьян и посадских людей, поэтому, скорее всего, основатель рода Авдюховых происходил из простого сословия. В дворянской среде чаще встречались фамилии на -ский или на полную, нередуцированную форму имени.

Интересно, что имя Авдей в старину не было редким, но и не входило в десятку самых популярных. Благодаря этому фамилия Авдюхов (и её женская форма Авдюхова) встречается в основном в центральных и южнорусских областях — там, где имя бытовало в своей разговорной версии. Если сравнивать с однокоренными фамилиями вроде Авдеев или Авдюшин, то Авдюхов стоит чуть ближе к народной, просторечной манере произношения, что ещё раз подтверждает: предки носителя этой фамилии были, скорее всего, людьми незнатными, но с твёрдой привязкой к православной традиции.