Фамилия Авдюхин образована от имени Авдюха — просторечной, обиходной формы церковного имени Авдий. Это имя библейское, древнееврейского происхождения, и в переводе с иврита оно означает «служащий Богу». Так звали одного из двенадцати малых пророков Ветхого Завета, а в святцах имя закрепилось в славянской традиции.

В русской ономастике модель Авдюхин — одна из самых типичных для фамилий, возникших из уменьшительных форм крестильных имен. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Авдюхин, то есть сын или потомок Авдюхи. А вот сам суффикс -юх- в основе (Авдюха) характерен для северных и северо-восточных говоров. В центральной России и на юге чаще использовали уменьшительные формы на -як, -ша, -уня, а вот формы на -юха (Авдюха, Валюха, Матюха) были особенно распространены в Архангельской, Вологодской и Вятской губерниях. Это даёт основание предполагать, что первые носители фамилии Авдюхин жили именно в этих краях.

Встречаются и однокоренные фамилии: Авдеев, Авдюков, Авдюшин. Все они идут от того же имени Авдий, но через разные суффиксальные варианты. Авдюхин стоит в этом ряду как самая «редкая» форма — не столько из-за редкости имени, сколько из-за узкой региональной привязки суффикса.

Имя Авдий в народной среде звучало непривычно для уха, поэтому его быстро «обкатывали» до привычных созвучий: Авдей, Авдюха, Авдюня. Потомок человека, которого в деревне звали Авдюхой, со временем и стал писаться как Авдюхин. Никакого ремесла или прозвища за этой фамилией не стоит — только крестильное имя, прошедшее через живую русскую речь.