Фамилия Авдюгин образована от имени Авдюга — народной, обиходной формы библейского имени Авдей. Канонический церковный вариант этого имени — Авдий, а в переводе с иврита оно означает «служащий Богу». Такие усечённые или уменьшительные формы (Авдюга, Авдюня, Авдя) были широко распространены в русской среде: вместо полного имени в быту часто использовали его более короткий и привычный для слуха вариант.

Фамилия построена по очень распространённой модели: к основе Авдюг- добавлен суффикс -ин. В русской ономастике суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Авдюгин, то есть сын Авдюги, потомок человека по имени Авдюга. Такая схема типична для фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я (сравните: Фомин, Ильин, Никитин). Если бы основа оканчивалась на согласный, мы бы увидели суффикс -ов (Авдеев — от Авдей).

Интересно, что у фамилии Авдюгин есть однокоренные «родственники»: Авдеев, Авдюшин, Авдюхов. Все они восходят к одному имени Авдей, но через разные народные формы. Авдюгин — одна из наименее частых ветвей этого гнезда. Встречается она преимущественно в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской и Рязанской областях, где имя Авдей было популярно среди крестьян.

Таким образом, предок современных Авдюгиных — человек, которого в быту звали Авдюга. Сама фамилия не указывает на сословие или род занятий: её носили и крестьяне, и мещане. Это чисто «отчество» в третьем поколении, закрепившееся как родовое имя.