Фамилия Авдюнин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Авдюнин послужило церковное имя Авдий. Мужское крестильное имя Авдий в переводе с древнееврейского означает «священнослужитель». В основу фамилии легла уменьшительно-ласкательная форма этого имени — Авдюня. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Авдюня, со временем получил фамилию Авдюнин. О точном месте и времени возникновения фамилии Авдюнин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Авдюнин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.