Фамилия Авдонины — одна из тех, что хранят в себе имя предка, но не самого распространённого, а его уменьшительную, домашнюю форму. В основе лежит имя Авдоня — так в быту могли звать человека, крещёного как Авдий. Церковное имя Авдий пришло из древнееврейского и означает «слуга Божий» (или «раб Господа»), что было распространённым смыслом для библейских имён. Однако в повседневной речи полные имена часто сокращали, добавляя ласкательный суффикс: Авдий превращался в Авдоню. От этого прозвищного имени и пошла фамилия.

Модель образования здесь классическая для русских фамилий: к основе Авдон- добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Буквально Авдонин — это «сын Авдони» или «человек из рода Авдони». Такая схема (крестильное имя → его народная форма → фамилия на -ин) типична для центральной России и Поволжья, где фамилии складывались в XVI–XVII веках.

Интересно, что имя Авдий в святцах встречается, но нечасто, поэтому и фамилия Авдонины — не массовая, а довольно редкая. Если встретили её носителя, велика вероятность, что его предки происходят из регионов, где бытовала именно эта форма имени — например, из-под Рязани или Тамбова. В некоторых говорах Авдоней могли называть и человека с именем Авдей (народный вариант того же Авдия), так что корень у фамилии один, а вариантов написания в старых документах могло быть несколько: Авдонин, Авдюнин, Авдеев — все они восходят к одному источнику.

Точную дату возникновения фамилии назвать невозможно: процесс шёл постепенно, и в каждой ветви рода она закреплялась в разное время. Но сам факт, что фамилия сохранила живую, разговорную форму имени, делает её не просто записью в метрике, а отражением того, как на самом деле звучало обращение к предку в его семье.