Фамилия Авдонин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Авдонин послужило церковное имя Авдий. Авдоня – одна из форм имени церковного имени Авдий, которое в переводе с еврейского означает «слуга Божий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Авдоня, со временем получил фамилию Авдонин. О точном месте и времени возникновения фамилии Авдонин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Авдонин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.