Фамилия Аякешов — редкий случай, когда корень слова почти наверняка не русский, а тюркский. В основе лежит имя или прозвище Аякеш. Его можно разобрать на две части: «аяк» (нога) и суффикс принадлежности или уменьшительности «-еш». В казахском, башкирском и татарском языках «аяк» означает не только ногу, но и чашу, пиалу — посуду для питья. Поэтому у фамилии два равноправных пути.

Первая версия: Аякеш — человек с характерной походкой, хромотой или, наоборот, быстроногий. Тюркские прозвища по частям тела были распространены: их давали не в обиду, а для точной приметы. Вторая версия отсылает к ремеслу или быту: Аякешем могли называть мастера, делавшего деревянные чаши (аяки), или просто того, кто любил попить из большой пиалы. Выбрать одну версию сложно, так как в документах XIX века фамилия не зафиксирована в большом количестве, чтобы проследить устойчивое значение.

Русский суффикс -ов указывает на патронимическую модель: «чей?» — Аякешов, то есть сын или потомок Аякеша. Это типичный способ русификации нерусских имен в Поволжье, Приуралье и Сибири. Фамилия могла возникнуть при переписях, когда татарам, башкирам или казахам записывали фамилию по отцу, добавляя русское окончание. Географически Аякешовы встречаются в Оренбургской, Челябинской областях и в Башкортостане — в зоне давнего смешения тюркского и русского населения.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Аяков, Аякбаев) показывает, что основа «аяк» в фамилиях встречается, но редко. Это делает Аякешова не массовой, а локальной фамилией, сохранившей конкретное прозвище предка — возможно, последнего мастера по чашам или человека с заметной походкой, чья примета осталась в родовом имени.