Фамилия Айнуллов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Главная подсказка — в строении: корень «Айнулл-» и русский суффикс «-ов», указывающий на принадлежность («сын такого-то»). Значит, в основе лежит личное имя Айнулла.

Имя Айнулла — арабского или тюркского происхождения, сложенное из двух частей: «айн» (глаз, источник, а в переносном смысле — суть, лучший) и «Аллах» (Бог). Наиболее вероятное значение — «глаз Бога» или «источник Божьей милости». В исламской традиции имена с компонентом «-улла» (Абдулла, Убайдулла) подчёркивают связь с Всевышним, божественный дар. Имя Айнулла встречается у татар, башкир, у народов Северного Кавказа и в Средней Азии.

По модели образования фамилия Айнуллов — классическая русская патронимическая фамилия, но возникла она в среде, где арабские и тюркские имена были привычны. Носители — скорее всего, потомки крещёных татар, башкир или других народов, перешедших в православие: в мусульманской среде фамилии на «-ов» стали массово появляться только в советское время. В XIX веке такие фамилии фиксировались в метрических книгах православных приходов Поволжья и Приуралья.

Интересная деталь: фамилия могла писаться и как Айнулин, если в основе лежала краткая форма имени — Айнул. Но вариант Айнуллов точнее передаёт полное имя и встречается чаще. Сравните с фамилиями Абдуллов, Убайдуллов — они образованы по тому же принципу.

О сословной принадлежности предков сказать определённо сложно. Скорее всего, это были государственные или экономические крестьяне, реже — мещане. Дворянских родов с такой фамилией в исторических списках нет. География бытования — преимущественно Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Самарская области. Встречается и в Казахстане, но там фамилия могла возникнуть позже, в советский период, из-за русификации имён.