Фамилия Айнуллова сразу выдает этническое и религиозное происхождение. Её основа — арабское имя Айнулла, что переводится как «око (источник) Аллаха» или «глаз Божий». В мусульманской традиции такие имена подчеркивают всеведение и милость Всевышнего, и они широко распространены у татар, башкир и других тюркских народов, исповедующих ислам.

Форма Айнуллова — женский вариант фамилии, образованный от мужской Айнуллов по стандартной русской модели: к основе на твердый согласный добавляется суффикс -ов, а затем окончание -а для женщин. Это типичный случай, когда фамилия закрепилась в документах в XIX — начале XX века, когда у татар и башкир начали массово записывать фамилии по русскому образцу. Суффикс -ов здесь указывает на принадлежность: Айнуллов буквально значит «сын Айнуллы». В татарской среде такие патронимы могли долго бытовать без фамилий как таковых: человека звали Айнулла, а его детей — Айнулловыми. Когда пришло время записывать фамилии, этот оборот и закрепился.

Споров вокруг происхождения фамилии почти нет: корень прозрачен. Первая часть «Айн» в арабском языке означает не только «глаз», но и букву айн (ع), а также название источника. Однако в данном контексте значение «око Аллаха» — общепринятое. Фамилия показывает, как исламская антропонимика адаптировалась к российской бюрократической системе: это чисто исламский антропоним, обрусевший по форме, но сохранивший восточное содержание. Никакой связи с еврейским именем Айнул или финно-угорскими корнями нет.

Географически фамилия Айнуллова встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах компактного проживания татар и башкир. Встречаются и варианты написания: Айнуллин (с суффиксом -ин, что тоже возможно для тюркских фамилий, хотя реже). Но Айнуллова — самая распространенная форма.