Фамилия Айтахунова — яркий пример фамилий, образованных от тюркского имени, и её стоит разбирать именно с этого угла, потому что суффикс здесь не главная загадка. Основа — мужское личное имя Айтахун. Оно составное: первая часть «ай» с тюркских языков переводится как «луна», вторая «тахун» восходит к персидскому «тахт» (трон, престол) или к тюркскому «тахун» (курица, наседка — в переносном смысле, как заботливая мать). Самая правдоподобная версия — «лунный трон» или «луна на троне», что звучит как поэтичное пожелание величия и светлой судьбы ребёнку. Встречается и толкование «луноподобный», но оно менее устойчиво.

Женская форма Айтахунова указывает, что фамилия принадлежит женщине, а мужской вариант — Айтахунов. Модель образования простая: к тюркскому имени добавили русский патронимический суффикс -ов, который в XIX–XX веках массово адаптировал нерусские фамилии под стандарты Российской империи. Суффикс -ин здесь не подошёл бы, потому что основа оканчивается на согласный.

Географически фамилия привязана к регионам, где исторически жили тюркские народы: Татарстан, Башкортостан, Казахстан, Узбекистан, а также отдельные группы в Киргизии и на Кавказе. В русских переписях фамилия редкая, встречается в основном в Поволжье и Западной Сибири. Интересно, что имя Айтахун почти не фиксируется в современных справочниках личных имён — оно архаичное, что делает фамилию своеобразным «архивом» исчезнувшей антропонимической традиции.

Сословно предки Айтахуновой, скорее всего, были крестьянами или мещанами. В дворянских родословных книгах такая фамилия не встречается — её носители получали её при переписях или в советских паспортах, когда требовалось закрепить отчество в виде фамилии. Никаких известных исторических деятелей с этой фамилией нет, и это нормально: большинство носителей — обычные люди, чья родословная уходит в сельские общины Средней Азии или Поволжья.