Фамилия Айтбакиев — редкий пример, когда в основе лежит не простое, а составное тюркское имя с религиозным оттенком. Разберём её не с конца, а с самого корня. Мужское имя Айтбакы сложилось из двух арабских заимствований, прочно вошедших в тюркскую ономастику: «айт» (от арабского «ид» — «праздник», в тюркских языках осмысляется как «рождённый в праздник») и «бакы» (от «баки» — «вечный», «бессмертный», один из эпитетов Аллаха). Прямое значение — «вечный праздник» или «праздник бессмертия»; родители вкладывали в имя пожелание долгой и счастливой жизни ребёнку.

Суффикс -ев указывает на русскую адаптацию по стандартной модели отчества: «чей?» — Айтбакиев, то есть сын или потомок Айтбакы. Такая модель складывалась у тюркских народов во второй половине XIX — начале XX века при контактах с русской администрацией. Фамилия не могла возникнуть раньше: в досоветский период у казахов, башкир и других тюрков наследственных фамилий не было — использовали отчества или родовые имена. Именно суффикс -ев, а не тюркский -улы или -кызы, выдаёт время и способ оформления фамилии.

По географии Айтбакиев встречается почти исключительно в Казахстане и среди казахов в приграничных регионах России (Оренбургская, Астраханская области). Это позволяет предположить, что предки относились к казахским родам, где имя Айтбакы было распространённым. Но здесь стоит обратить внимание на уникальность второй части основы. В тюркских фамилиях гораздо чаще встречаются имена с «бай» (богач) или «бек» (господин), несущие социальный смысл. Вариант с «бакы» — сакральный, отсылающий к вечности как атрибуту Бога. Для тюркских фамилий это нехарактерно. Сравните с однокоренной фамилией Айтбаев (от имени Айтбай — «праздничный богач»): там вторая часть указывает на статус, а здесь — на религиозную идею. Это может говорить о том, что предок происходил из семьи, где ценили имена с богословским оттенком, либо имя дали в память о событии, совпавшем с праздником и пожеланием долголетия.

Точных сведений о сословной принадлежности первых носителей нет. Модель образования (отчество без суффикса принадлежности к знатному роду) намекает на происхождение из числа простых кочевников или крестьян. Фамилия не дворянская и не княжеская. В советское время она закрепилась как наследственная, и сейчас её носители живут в основном в Казахстане.