Фамилия Бабасев образована по очень распространённой модели: к основе, в данном случае «Бабас», добавился патронимический суффикс -ев. Этот суффикс указывает на принадлежность («чей?») — буквально «сын Бабаса» или «потомок Бабаса». Такая модель типична для русских фамилий, возникших из прозвищ или мирских имён.

Корень «Бабас» неоднозначен, и здесь стоит разобрать две основные версии. Первая, самая прямая: прозвище Бабас мог получить человек с мягким, нерешительным характером или тот, кого считали изнеженным. В русских говорах слово «баба» нередко давало производные с оттенком пренебрежения или шутки, и «бабас» — один из таких вариантов. Вторая версия связана с тюркскими языками: в некоторых из них «баба» означает «отец», «дед», а «бабас» могло быть уважительным обращением к старшему или даже личным именем. Учитывая, что фамилия встречается в регионах с татарским и башкирским населением, эта версия не менее правдоподобна, чем первая.

В пользу тюркского следа говорит и то, что фамилия Бабасев — не единственная в этом ряду. Есть однокоренные Бабасов, Бабасин, а также более редкие формы с суффиксом -ов, что характерно для русификации тюркских имён. В дореволюционных переписях носители фамилии фиксировались в основном в Поволжье и на Урале — в губерниях, где русское и тюркское население веками жило рядом.

Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или на «ц». Фамилия писалась устойчиво, без вариантов, что говорит о её относительно позднем оформлении — скорее всего, в XVIII–XIX веках, когда фиксация фамилий стала обязательной для всех сословий.

Таким образом, фамилия Бабасев почти наверняка имеет либо прозвищное русское происхождение (от «бабас» — неженка), либо восходит к тюркскому имени-обращению. В любом случае, предок носителя этой фамилии был человеком, которого в округе знали по этому характерному признаку или имени.