Фамилия Бакаушин — редкий случай, когда за основой могут стоять два совершенно разных мира: крестьянское плетение корзин и санный промысел. Первая версия отсылает к владимирским говорам, где «бакаушкой» называли небольшую четырёхугольную корзинку из драни. Прозвище Бакауша мог получить либо тот, кто постоянно носил такую корзинку, либо мастер, который их плел. Вторая версия ведёт на Урал, где существовало слово «бокоуша» — так называли специальные крылья на санях, чтобы те не переворачивались при раскате. Тогда Бакаушей прозвали человека, который либо ездил на таких санях, либо их чинил. Интересно, что «бокоушами» называли и часть головы ниже уха, так что прозвище могло указывать и на внешнюю особенность — например, на форму скул или челюсти.

Словообразовательная модель проста: к основе Бакауш- добавился типичный русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Бакауши). Фамилии на -ин чаще всего образовывались от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а/-я, поэтому Бакаушин логично вписывается в этот ряд.

Географически фамилия встречается редко, что подтверждает её диалектное происхождение: она привязана к двум удалённым друг от друга ареалам — Владимирщине и Уралу. Это говорит о том, что разные ветви рода могли возникнуть независимо, в разных местностях, и лишь потом фамилия закрепилась как наследственная. Окончательно определить, какая из версий верна для конкретной семьи, можно только через архивные записи: метрические книги, ревизские сказки или писцовые книги той губернии, откуда пошёл род.